アカウントAで、アカウントBのプライベートホストゾーンの名前解決をしたい場合は反対の作業をやる

• アカウントAで、プライベートホストゾーンの準備できること
  • プライベートホストゾーンの確認 (aws route53 list-hosted-zones )
• アカウントAとアカウントBのVPC画面で、以下のDNS設定が [有効] になっていることを確認
• アカウントBで、VPC IDを確認する

$ aws route53 list-hosted-zones

{
    "HostedZones": [
        {
        (略)
        {
            "Id": "/hostedzone/Z01363732OJ20G9YLROAW",
            "Name": "example.com.",
            "CallerReference": "2021-09-01_01-52-27",
            "Config": {
                "PrivateZone": false
            },
            "ResourceRecordSetCount": 2
        }
        (略)

アカウント A のプライベートホストゾーンとアカウント B の VPC との関連付けを許可します。

$ HOSTED_ZONE_ID=<hosted-zone-id> # アカウントAのプライベート ホストゾーンID
$ VPC_ID=<vpc-id>                 # アカウントBの VPC ID
$ REGION=ap-northeast-1           # アカウントBのリージョン

# [create-vpc-association-authorization] を実行
$ aws route53 create-vpc-association-authorization \
   --hosted-zone-id ${HOSTED_ZONE_ID} \
   --vpc VPCRegion=${REGION},VPCId=${VPC_ID} \
   --region ${REGION}

アカウント A のプライベートホストゾーンとアカウント B の VPC 間の関連付けを作成します。

$ HOSTED_ZONE_ID=<hosted-zone-id> # アカウントAのプライベート ホストゾーンID
$ VPC_ID=<vpc-id>                 # アカウントBの VPC ID
$ REGION=ap-northeast-1

# [associate-vpc-with-hosted-zone] を実行
$ aws route53 associate-vpc-with-hosted-zone \
   --hosted-zone-id ${HOSTED_ZONE_ID} \
   --vpc VPCRegion=${REGION},VPCId=${VPC_ID} \
   --region ${REGION}

アカウントAのRoute53 画面を更新すると、[関連付けられたVPC] にアカウントBの VPC ID が追加されています。

アソシエーションを作成したら、アソシエーション権限を削除するのがベストプラクティスです。
同じVPC IDからのVPC関連付けの再実行を防ぐためです。

$ HOSTED_ZONE_ID=<hosted-zone-id> # アカウントAのプライベート ホストゾーンID
$ VPC_ID=<vpc-id>                 # アカウントBの VPC ID
$ REGION=ap-northeast-1

$ aws route53 list-vpc-association-authorizations \
    --hosted-zone-id ${HOSTED_ZONE_ID}

$ HOSTED_ZONE_ID=<hosted-zone-id> # アカウントAのプライベート ホストゾーンID
$ VPC_ID=<vpc-id>                 # アカウントBの VPC ID
$ REGION=ap-northeast-1

$ aws route53 delete-vpc-association-authorization \
   --hosted-zone-id ${HOSTED_ZONE_ID} \
   --vpc VPCRegion=${REGION},VPCId=${VPC_ID} \
   --region ${REGION}

$ HOSTED_ZONE_ID=<hosted-zone-id> # アカウントAのプライベート ホストゾーンID
$ VPC_ID=<vpc-id>                 # アカウントBの VPC ID
$ REGION=ap-northeast-1

$ aws route53 list-vpc-association-authorizations \
    --hosted-zone-id ${HOSTED_ZONE_ID}

• Route 53 プライベートホストゾーンを別の AWS アカウントの VPC に関連付ける | AWS re:Post
• 【Route 53】別アカウントのプライベートホストゾーンを名前解決 - ふにノート